Dự án được bắt đầu năm 2006 lạp trình viên người Đài Loan Hong Jen Yee (tiếng Trung: 洪任諭; bính âm: Hóng Rènyù), còn gọi là PCMan, khi ông phát hành PCManFM, một trình quản lý file mới và mô-đun đầu tiên của LXDE.

So sánh bảng xếp hạng phân phối của DistroWatch vào đầu tháng 1 năm 2011 cho năm 2010 so với năm 2009, Ladislav Bodnar lưu ý sự gia tăng mức độ phổ biến của LXDE so với các môi trường máy tính để bàn khác. Ông nói:

Nhìn qua các bảng, một điều thú vị là sự gia tăng của các bản phân phối sử dụng máy tính để bàn LXDE nhẹ, nhưng đầy đủ tính năng hoặc trình quản lý cửa sổ Openbox. Ví dụ, giờ đây, Lubuntu thoải mái đánh bại Kubuntu về lượt truy cập trang, trong khi CrunchBang Linux, một bản phân phối nhẹ với Openbox vẫn nằm trong top 25 mặc dù nó không tạo được bản phát hành ổn định trong hơn một năm. Nhiều bản phân phối khác bắt đầu cung cấp các phiên bản dựa trên LXDE cho các sản phẩm của họ, góp phần tăng thêm sự phổ biến của môi trường desktop tương đối mới này.[13]

Qt port

Không hài lòng với GTK+ 3,[14] Hong Jen Yee đã thử nghiệm với Qt đầu năm 2013[15] và phát hành phiên bản đầu tiên của PCManFM dựa trên Qt ngày 26 tháng 3 năm 2013.[14]

Ngày 3 tháng 7 năm 2013 Hong đã công bố một port Qt đầy đủ của cả bộ LXDE,[16] và vào ngày 21 tháng 7 Razor-qt và LXDE thông báo rằng họ sẽ hợp nhất hai dự án.[17][18][19] Việc sáp nhập này có nghĩa là phiên bản GTK+ và Qt sẽ cùng tồn tại trong một thời gian nhưng cuối cùng, phiên bản GTK sẽ bị loại bỏ và mọi nỗ lực tập trung vào port Qt.[20]